En un comunicado del 23 de septiembre, Anthropic afirmó que su gran modelo de lenguaje (LLM), Claude, había identificado un sistema enzimático con propiedades "que recuerdan a CRISPR", la herramienta de edición genérica galardonada con el Premio Nobel.
Según Anthropic, unos 950 agentes de Claude que funcionaban simultáneamente encontraron las secuencias genéticas de interés en 21.5 horas. "Felicito sinceramente a Anthropic por dar a conocer al mundo su descubrimiento", afirma Fyodor Urnov, experto en edición genética de la Universidad de California en Berkeley y director de I+D (Investigación y Desarrollo) terapéutica en su Instituto de Genómica Innovadora (IGI). El IGI colabora con Anthropic, pero no ha participado en el nuevo descubrimiento.
Otros científicos se muestran menos entusiastas con el hallazgo, que es el primero que surge de un grupo de investigación formado por Anthropic a principios de este año. "Los experimentos aún están en curso. El comunicado de prensa ya está publicado", afirma Le Cong, profesor de la Universidad de Stanford especializado en la integración de la IA en la investigación sobre ingeniería genómica.
Anthropic, que ha creado un laboratorio de investigación para el descubrimiento de fármacos, ha dejado claro que este hallazgo no supone el final de su trabajo. "Aún no entendemos qué hace este sistema, pero solo un puñado de sistemas conocidos comparten sus características, y todos ellos son capaces de cortar, copiar y pegar ADN", afirmó la empresa en una publicación en X. Se incluyó un experimento físico en un informe técnico, que aún no ha sido revisado por pares. Sin embargo, queda mucho por hacer para determinar la importancia de este descubrimiento. Sigue sin saberse si este sistema enzimático puede utilizarse como herramienta de edición genética y, en caso afirmativo, si resulta útil para tal fin.
"Imaginemos que estamos en la playa de Santa Mónica e intentamos examinar toda la arena para encontrar un diamante. La IA ha encontrado algo que brilla mucho, y entonces hay que volver al laboratorio para saber: ¿es cristal? ¿Es un diamante?", explica Cong.
Claude encontró este hallazgo después de que investigadores de Anthropic le pidieran buscar en enormes bases de datos genómicas "nuevos ejemplos interesantes" de transcriptasas inversas, proteínas capaces de copiar ARN en ADN. Este proceso ocurre en sentido contrario al habitual en nuestras células, donde el ADN se transcribe en ARN. Sin embargo, otros organismos utilizan las transcriptasas inversas para distintas funciones biológicas, entre ellas la inserción de segmentos de ADN.
Startups and Big Ag are using Crispr gene editing to create crops that taste better and grow on a hotter planet. But will they find a market?
Anthropic llama a su sistema ART
Según Anthropic, los agentes de Claude identificaron inicialmente más de 200,000 posibles transcriptasas inversas. Después redujeron la lista a varios miles de candidatos que parecían ser nuevos y siguieron filtrándolos hasta encontrar una familia "inusual" de estas proteínas, asociada a una larga región de secuencias de ADN repetidas similares a CRISPR.
Anthropic llama a este sistema ART, siglas de array-associated reverse transcriptases (transcriptasas inversas asociadas a matrices). El sistema aparece en fagos gigantes, virus de gran tamaño que infectan bacterias.
"Puedo ver a simple vista una matriz de repeticiones en tándem… ¿es eso una matriz de repeticiones similar a CRISPR?", escribió un agente de IA. El agente también identificó que este sistema podría ser un retrón, como señala el informe técnico. Tanto CRISPR como los retrones forman parte de los sistemas de defensa de las bacterias, aunque funcionan de manera distinta. Los retrones también pueden aprovecharse para la edición genética, pero no son una herramienta tan versátil como CRISPR. Por eso, no sorprende que Anthropic destacara sobre todo la comparación con CRISPR en su publicación.
Seth Shipman, investigador asociado de los Institutos Gladstone, no cree que lo que ha encontrado Anthropic sea un nuevo sistema CRISPR, pero afirma que el descubrimiento sigue siendo interesante. "Lo novedoso es cómo lo encontraron, no lo que es", afirma. Su laboratorio ha utilizado retrones para crear sistemas de edición genética, por lo que es posible emplear los retrones de esta manera.
